Além da alimentação da base de dados para o MEC e para a própria instituição, a Comissão tem um papel importante na avaliação institucional externa. Seu trabalho é orientado em consonância com os instrumentos de avaliação do MEC, conforme Portaria de nº 2051 de 09 de julho de 2004. O documento explicita as diversas dimensões a serem avaliadas, em conformidade com o Sistema Nacional de Avaliação da Educação Superior (Sinaes), que confere o peso de 20% da nota final atribuída à instituição. Para que a CPA cumpra seu papel, de modo significativo, precisa contar com o suporte de toda a comunidade acadêmica e administrativa, num esforço contínuo e programado.